More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2090 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
253 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1871  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 
258 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  48.56 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4495  enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166279  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  48.56 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  48.56 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  48.09 
 
 
258 aa  195  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  42.26 
 
 
263 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2071  enoyl-CoA hydratase  47.92 
 
 
255 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0296797  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2134  enoyl-CoA hydratase  47.92 
 
 
255 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0100936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2088  enoyl-CoA hydratase  47.92 
 
 
255 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109638  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2320  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 
270 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0702253  normal  0.0764248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4139  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 
265 aa  191  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.25 
 
 
245 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12846  enoyl-CoA hydratase  48.61 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000117946  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4034  enoyl-CoA hydratase  44.22 
 
 
270 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0345  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918373  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.26 
 
 
237 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0385  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.44 
 
 
243 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.74 
 
 
254 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 
267 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
261 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.79 
 
 
263 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 
261 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  42.44 
 
 
260 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.33 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.42 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.56 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.01 
 
 
263 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.62 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
259 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  41.56 
 
 
268 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  43.48 
 
 
261 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.12 
 
 
259 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 
260 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.45 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  39.81 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  38.94 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  44.2 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  40.45 
 
 
260 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
265 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
260 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  42.18 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 
260 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  43.69 
 
 
253 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
258 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 
265 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 
260 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.71 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.96 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  35.85 
 
 
258 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
251 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  35.85 
 
 
258 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 
262 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.15 
 
 
657 aa  135  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.41 
 
 
258 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.86 
 
 
663 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.81 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.45 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.69 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  42.62 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.67 
 
 
260 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.36 
 
 
266 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 
259 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.78 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  41.55 
 
 
261 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 
267 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
259 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  39.65 
 
 
267 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
258 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.41 
 
 
260 aa  131  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.58 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  41.75 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.98 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.17 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  38.5 
 
 
663 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  38.96 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  33.85 
 
 
657 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.23 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  39.42 
 
 
253 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 
260 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.62 
 
 
268 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.72 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  42.35 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.58 
 
 
258 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
260 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
260 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>