More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1772 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 268 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5272  short chain enoyl-CoA hydratase  54.98 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000022289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2749  short chain enoyl-CoA hydratase  51.42 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439722  normal  0.238533 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.21 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  34.94 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.43 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  34.94 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3963  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.54 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.1 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.55 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2128  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00663938 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 258 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 262 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 259 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.72 
 
 		 657 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 		 257 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.08 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>