More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0649 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
261 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  58.63 
 
 
263 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  56.91 
 
 
267 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  57.44 
 
 
261 aa  265  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  56.13 
 
 
263 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.92 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.53 
 
 
260 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  44.27 
 
 
260 aa  218  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.14 
 
 
260 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.14 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  42.58 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.59 
 
 
265 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.48 
 
 
260 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
262 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.36 
 
 
260 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.41 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.36 
 
 
256 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  44.83 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  48.79 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
260 aa  195  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 
258 aa  194  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.76 
 
 
260 aa  194  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.68 
 
 
260 aa  194  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.28 
 
 
260 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
266 aa  193  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
258 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
261 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 
262 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.67 
 
 
259 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
263 aa  191  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
263 aa  191  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.02 
 
 
259 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
268 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 
257 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.58 
 
 
258 aa  188  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.63 
 
 
263 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.29 
 
 
260 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
257 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 
260 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
257 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 
262 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
258 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.09 
 
 
258 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 
265 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
261 aa  185  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
257 aa  185  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 
262 aa  185  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 
258 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.76 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  42.28 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.55 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  43.32 
 
 
661 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.31 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
258 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.08 
 
 
261 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.76 
 
 
259 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
264 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
258 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
258 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
258 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  42.91 
 
 
258 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
258 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 
258 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
258 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
277 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  42.91 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
262 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 
259 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
258 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  41.63 
 
 
663 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 
256 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 
257 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 
257 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 
251 aa  181  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.4 
 
 
260 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.53 
 
 
258 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.5 
 
 
257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.68 
 
 
257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  43.2 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.5 
 
 
257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>