More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2206 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  70.99 
 
 
267 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  71.43 
 
 
261 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  67.3 
 
 
263 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  56.13 
 
 
261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.51 
 
 
260 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.13 
 
 
260 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.89 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 
260 aa  216  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.53 
 
 
260 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 
265 aa  209  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 
260 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
260 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.3 
 
 
261 aa  198  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 
259 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 
259 aa  195  6e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 
260 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 
260 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.53 
 
 
261 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  40.32 
 
 
258 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  40.32 
 
 
258 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  45.78 
 
 
260 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.31 
 
 
260 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.93 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.51 
 
 
263 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.17 
 
 
260 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  40.3 
 
 
662 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
260 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 
260 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.65 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
262 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  41.15 
 
 
663 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 
267 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
264 aa  181  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
260 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
257 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
257 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.78 
 
 
662 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.54 
 
 
662 aa  179  4e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.94 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.55 
 
 
663 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  38.96 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
260 aa  178  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 
258 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 
263 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 
263 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
263 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
269 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 
265 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
263 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
263 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
263 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 
257 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.46 
 
 
259 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  43.19 
 
 
267 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
263 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.78 
 
 
260 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 
261 aa  176  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.55 
 
 
661 aa  175  5e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
257 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42 
 
 
260 aa  175  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.45 
 
 
259 aa  175  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
259 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.71 
 
 
262 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  41.29 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  39.52 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
260 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.02 
 
 
260 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
260 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 
258 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.02 
 
 
260 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
258 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
258 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
260 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
258 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>