More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0858 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  40.53 
 
 
259 aa  202  5e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.89 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 
260 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.51 
 
 
260 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
258 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
260 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  41.51 
 
 
262 aa  188  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.38 
 
 
260 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.3 
 
 
255 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
258 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  43.4 
 
 
258 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.31 
 
 
258 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.78 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.33 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 
258 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
257 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
258 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.77 
 
 
260 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  41.38 
 
 
257 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
260 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
260 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.29 
 
 
261 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
258 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
258 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.39 
 
 
260 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  41 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  39.25 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  41.7 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
258 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
260 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.46 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  41.11 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  40.73 
 
 
663 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
259 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
257 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  38.95 
 
 
257 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 
258 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 
267 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
258 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
259 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 
259 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  40.53 
 
 
258 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
263 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
258 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
268 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.7 
 
 
260 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.87 
 
 
260 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  40.53 
 
 
258 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
267 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
263 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
262 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 
258 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
262 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.3 
 
 
257 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 
257 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 
257 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 
257 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
262 aa  175  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
262 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
257 aa  175  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
262 aa  175  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.25 
 
 
259 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
257 aa  175  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
258 aa  175  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
258 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 
258 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 
258 aa  175  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
258 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  41.04 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.39 
 
 
661 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>