More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5100 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  73.05 
 
 
256 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  50.81 
 
 
266 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  40.33 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
266 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
271 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 
268 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  38.62 
 
 
663 aa  161  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.34 
 
 
261 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 
258 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
259 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
263 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
271 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
264 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 
251 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
260 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
268 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  40.82 
 
 
261 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.65 
 
 
662 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.25 
 
 
662 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
262 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.03 
 
 
659 aa  155  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
260 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
265 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 
273 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
263 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1906  short chain enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 
259 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34521  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
263 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
263 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  36.14 
 
 
261 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
263 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  39 
 
 
260 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
261 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40 
 
 
257 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
260 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39.36 
 
 
255 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.44 
 
 
278 aa  151  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
262 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
255 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
255 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.96 
 
 
255 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
255 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 
263 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
255 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.06 
 
 
661 aa  149  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
260 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 
263 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
263 aa  150  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
261 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
259 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 
267 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.93 
 
 
267 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
265 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.55 
 
 
255 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.25 
 
 
662 aa  148  7e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
274 aa  148  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 
260 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.37 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
258 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.37 
 
 
260 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
256 aa  145  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.37 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.25 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 
245 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
260 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
258 aa  144  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
259 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
258 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  38.25 
 
 
261 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.41 
 
 
260 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.6 
 
 
258 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
258 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
258 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  41.46 
 
 
265 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>