More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1417 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  58.53 
 
 
263 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.09 
 
 
253 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.2 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2320  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
270 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0702253  normal  0.0764248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.47 
 
 
260 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.94 
 
 
260 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 
268 aa  175  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4139  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
265 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2134  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 
255 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0100936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2088  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 
255 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2071  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 
255 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0296797  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4034  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
270 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12846  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000117946  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.74 
 
 
260 aa  165  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0345  enoyl-CoA hydratase  45.59 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918373  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 
245 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.79 
 
 
258 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
260 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 
257 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 
257 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  39.74 
 
 
258 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 
257 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 
263 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4495  enoyl-CoA hydratase  44.64 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166279  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.91 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1871  enoyl-CoA hydratase  45.09 
 
 
258 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.91 
 
 
264 aa  159  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.56 
 
 
259 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  36.04 
 
 
262 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 
258 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.78 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.61 
 
 
260 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  39.56 
 
 
257 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
258 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  39.56 
 
 
257 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  39.56 
 
 
257 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.53 
 
 
262 aa  154  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  40.09 
 
 
257 aa  154  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.09 
 
 
258 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 
262 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.72 
 
 
257 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.47 
 
 
258 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.98 
 
 
264 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.7 
 
 
258 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.28 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.33 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.73 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
260 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.08 
 
 
258 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.28 
 
 
257 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.28 
 
 
257 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  42.27 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  38.5 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  40.6 
 
 
261 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.25 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.75 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.62 
 
 
260 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
261 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 
258 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  38.86 
 
 
261 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 
259 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.89 
 
 
260 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.58 
 
 
260 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  38.6 
 
 
258 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.92 
 
 
259 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 
257 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
253 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
258 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
258 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  41.05 
 
 
263 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 
259 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 
260 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.94 
 
 
256 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  38.77 
 
 
259 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.28 
 
 
257 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
258 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
256 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
260 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.56 
 
 
257 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  40.99 
 
 
259 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
261 aa  148  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 
259 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
257 aa  148  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.61 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  40.09 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  37.28 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  37.61 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  39.47 
 
 
261 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  38.05 
 
 
258 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
260 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  37.44 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>