More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2088 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2088  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2071  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0296797  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2134  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0100936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2320  enoyl-CoA hydratase  80.65 
 
 
270 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0702253  normal  0.0764248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12846  enoyl-CoA hydratase  82 
 
 
249 aa  388  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000117946  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4034  enoyl-CoA hydratase  78.23 
 
 
270 aa  384  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0345  enoyl-CoA hydratase  47.21 
 
 
277 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918373  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.92 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  48.36 
 
 
257 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  48.36 
 
 
257 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 
257 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4495  enoyl-CoA hydratase  50.95 
 
 
258 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166279  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  43.68 
 
 
263 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1871  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 
258 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 
258 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.72 
 
 
245 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4139  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
265 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.6 
 
 
237 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0385  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 
243 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.07 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.13 
 
 
255 aa  139  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
258 aa  138  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.21 
 
 
250 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
256 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 
260 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.08 
 
 
260 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.68 
 
 
260 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
257 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
260 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.29 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
259 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
257 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.39 
 
 
255 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.94 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.57 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
257 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
257 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
259 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.59 
 
 
264 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
259 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
277 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 
262 aa  129  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.9 
 
 
257 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
258 aa  128  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.95 
 
 
273 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.81 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
261 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  37.27 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  38.92 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
259 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.09 
 
 
256 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
258 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.12 
 
 
260 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 
260 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.18 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  37.27 
 
 
258 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
259 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
269 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1190  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.18 
 
 
258 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
262 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 
260 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 
258 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.45 
 
 
255 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
258 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.45 
 
 
255 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
258 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.45 
 
 
255 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4646  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.6 
 
 
259 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
258 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>