More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3960 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
273 aa  549  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  73.38 
 
 
269 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  73.38 
 
 
269 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  73.38 
 
 
269 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  74.52 
 
 
287 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  72.14 
 
 
266 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  71.81 
 
 
263 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  72.59 
 
 
263 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  67.05 
 
 
266 aa  359  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  66.8 
 
 
264 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  64.39 
 
 
264 aa  322  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 
264 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.22 
 
 
271 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.75 
 
 
269 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.15 
 
 
269 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.05 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
262 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  43.4 
 
 
253 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  43.68 
 
 
266 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 
247 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 
247 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 
247 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
254 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
254 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
264 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 
257 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 
254 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  41.64 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.59 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.84 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
256 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
254 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
253 aa  168  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
255 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 
266 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 
249 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
249 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 
254 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  41.04 
 
 
249 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  41.04 
 
 
249 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  40.31 
 
 
254 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.61 
 
 
285 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
273 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
262 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.79 
 
 
271 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  37.98 
 
 
264 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
254 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
262 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
271 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  38.13 
 
 
260 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 
258 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
257 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  38.22 
 
 
261 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 
266 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 
259 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
262 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
262 aa  148  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
254 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
261 aa  148  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2844  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.63 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
258 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
258 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
256 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
258 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
264 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
262 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
274 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 
254 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 
259 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
258 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
258 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
273 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
259 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  37.83 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 
258 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>