More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0876 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.81 
 
 
246 aa  194  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.668751  normal  0.0257494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  38.72 
 
 
263 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1871  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 
258 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4495  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166279  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
257 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
257 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.24 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  37.39 
 
 
259 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  38.54 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.44 
 
 
260 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.24 
 
 
258 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  37.87 
 
 
270 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
257 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
265 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  35.24 
 
 
259 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 
259 aa  129  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4034  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2320  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 
270 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0702253  normal  0.0764248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0345  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
277 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918373  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0385  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.95 
 
 
243 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 
236 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2071  enoyl-CoA hydratase  40.21 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0296797  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2088  enoyl-CoA hydratase  40.21 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2134  enoyl-CoA hydratase  40.21 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0100936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 
261 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 
257 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 
264 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
253 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
261 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.24 
 
 
258 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  33.79 
 
 
256 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.17 
 
 
256 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 
256 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 
263 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  34.3 
 
 
265 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  35.81 
 
 
254 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
260 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 
269 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.12 
 
 
260 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  33.63 
 
 
257 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  33.63 
 
 
257 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 
265 aa  122  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.89 
 
 
237 aa  121  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 
268 aa  121  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
261 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.63 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.06 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  33.63 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
264 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  35.65 
 
 
262 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  33.79 
 
 
266 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
264 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.76 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  33.64 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.79 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  36.53 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
264 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  33.91 
 
 
264 aa  118  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.74 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  36.45 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.61 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.62 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  43.35 
 
 
252 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12846  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
249 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000117946  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 
261 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 
264 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 
258 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.87 
 
 
258 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14230  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  36.63 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0814417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.74 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.11 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
273 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
250 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
287 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
257 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.24 
 
 
269 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
257 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
257 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>