More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1436 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  60.84 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  58.14 
 
 		 261 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  58.02 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.47 
 
 		 273 aa  291  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.15 
 
 		 266 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.25 
 
 		 263 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  54.02 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  57.69 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  57.69 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 		 275 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.47 
 
 		 276 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  55.81 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.1 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.87 
 
 		 265 aa  275  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.71 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.09 
 
 		 269 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.06 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.45 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  54.69 
 
 		 265 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  52.87 
 
 		 269 aa  265  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  54.37 
 
 		 262 aa  265  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  53.03 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.09 
 
 		 266 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.37 
 
 		 269 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 		 266 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.69 
 
 		 270 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  54.33 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  53.38 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  54.02 
 
 		 269 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  51.32 
 
 		 278 aa  255  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.37 
 
 		 265 aa  254  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.47 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  55.2 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  58.62 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  51.87 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  57.14 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  51.14 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  51.14 
 
 		 290 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  51.14 
 
 		 290 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  52.36 
 
 		 264 aa  251  9.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 		 261 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.21 
 
 		 262 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 		 264 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  51.32 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  53.23 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  50.38 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.12 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.58 
 
 		 269 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  54.62 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.87 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.19 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  51.16 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.41 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.6 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.91 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.62 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.86 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.25 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  37.21 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 		 255 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.16 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  34.19 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 254 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>