More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3997 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  81.96 
 
 		 266 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  82.1 
 
 		 261 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  82.1 
 
 		 261 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  81.71 
 
 		 261 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  82.61 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  79.54 
 
 		 278 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  76.81 
 
 		 264 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  78.68 
 
 		 264 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  79.07 
 
 		 290 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  79.07 
 
 		 290 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  75.57 
 
 		 264 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  77.52 
 
 		 264 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  74.4 
 
 		 265 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.03 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.69 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.69 
 
 		 262 aa  305  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  65.35 
 
 		 257 aa  301  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  59.13 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 		 269 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.37 
 
 		 269 aa  298  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  59.45 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.16 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 269 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 		 280 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  58.98 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  58.78 
 
 		 269 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  57.14 
 
 		 269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.09 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  59.44 
 
 		 267 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  55.09 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.72 
 
 		 269 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.28 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  58.47 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.98 
 
 		 263 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  56.35 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 		 264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.3 
 
 		 275 aa  267  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.9 
 
 		 266 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  55.43 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.45 
 
 		 273 aa  265  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.89 
 
 		 261 aa  261  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  50.97 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  52.67 
 
 		 266 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  51.85 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.15 
 
 		 260 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.27 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  52.49 
 
 		 275 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 		 261 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  54.44 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.26 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.88 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.94 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  50.55 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.67 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  48.85 
 
 		 274 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.22 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  48.73 
 
 		 275 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.98 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  44.91 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.41 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  47.69 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  45.63 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.02 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 		 258 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 		 260 aa  131  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 258 aa  128  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>