More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4763 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
265 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.25 
 
 
265 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.25 
 
 
265 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  93.18 
 
 
266 aa  487  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.42 
 
 
262 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  45.24 
 
 
297 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 
261 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  45.24 
 
 
261 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  45.24 
 
 
261 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  45.24 
 
 
297 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  45.24 
 
 
261 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  45.24 
 
 
261 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3664  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.13 
 
 
264 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  42.17 
 
 
264 aa  178  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 
260 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  44.44 
 
 
297 aa  178  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 
259 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  43.25 
 
 
261 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  43.25 
 
 
261 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.86 
 
 
261 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  42.86 
 
 
261 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.86 
 
 
261 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.7 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.5 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 
266 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  44.44 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  44.05 
 
 
261 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  42.19 
 
 
257 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
258 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 
269 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  41.43 
 
 
260 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
260 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  43.2 
 
 
261 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  42.17 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.05 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 
255 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 
255 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 
255 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
259 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
262 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.87 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.38 
 
 
260 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.29 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.29 
 
 
260 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
260 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
260 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 
255 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  39.44 
 
 
260 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
262 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  39.84 
 
 
260 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
261 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.57 
 
 
260 aa  158  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
261 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 
257 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
258 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
256 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
263 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
265 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
260 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.37 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
258 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
267 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
261 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.08 
 
 
259 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
262 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  43.2 
 
 
263 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
262 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.53 
 
 
662 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  41.27 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.36 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 
258 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
257 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.06 
 
 
260 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 
271 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
260 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
260 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
258 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
258 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 
258 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
258 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
259 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
262 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
262 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
260 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
260 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
260 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 
265 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
262 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 
262 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
262 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
257 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
257 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>