More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4900 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
266 aa  527  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  97.37 
 
 
270 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  86.77 
 
 
265 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  81.25 
 
 
260 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.08 
 
 
260 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  60.31 
 
 
275 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  59.77 
 
 
275 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  61.18 
 
 
273 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.91 
 
 
273 aa  289  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  59.22 
 
 
275 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  59.14 
 
 
275 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.18 
 
 
276 aa  285  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.98 
 
 
263 aa  274  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  59.29 
 
 
270 aa  272  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 
261 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.09 
 
 
275 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  56.3 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 
274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  56.92 
 
 
264 aa  265  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
261 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 
261 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  55.81 
 
 
266 aa  259  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  55.77 
 
 
278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  53.33 
 
 
262 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  52.71 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  55 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  54.3 
 
 
264 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 
261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.49 
 
 
266 aa  251  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  54.3 
 
 
264 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  53.91 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 
264 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  54.3 
 
 
290 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  54.3 
 
 
290 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  51.18 
 
 
277 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  52.55 
 
 
269 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 
272 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 
272 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  55.69 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.67 
 
 
262 aa  244  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.25 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.63 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  53.2 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.43 
 
 
269 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  56.64 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 
269 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.16 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  54.03 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  54.69 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
269 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.75 
 
 
260 aa  229  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  50.99 
 
 
265 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  53.57 
 
 
273 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 
267 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.39 
 
 
270 aa  221  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.86 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.26 
 
 
272 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  48.26 
 
 
272 aa  208  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  50.39 
 
 
280 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.33 
 
 
261 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 
257 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.53 
 
 
269 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.62 
 
 
269 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.08 
 
 
257 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.44 
 
 
255 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 
257 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
264 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
255 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
266 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  40.76 
 
 
264 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
264 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
263 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
267 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  40.85 
 
 
264 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
260 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0345  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 
277 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918373  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  32.83 
 
 
268 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
252 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
260 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.68 
 
 
258 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.29 
 
 
253 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 
263 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
257 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>