More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2705 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  93.8 
 
 
275 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  89.42 
 
 
275 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  75.55 
 
 
275 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  74.07 
 
 
273 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.25 
 
 
273 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  62.31 
 
 
266 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.03 
 
 
276 aa  315  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.58 
 
 
263 aa  292  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.2 
 
 
260 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  55.15 
 
 
274 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  58.56 
 
 
261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 
273 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.69 
 
 
275 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.77 
 
 
266 aa  278  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.2 
 
 
266 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.63 
 
 
260 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
270 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.38 
 
 
270 aa  275  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.69 
 
 
265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  51.92 
 
 
264 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 
277 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  60.38 
 
 
261 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.06 
 
 
265 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  51.54 
 
 
261 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  51.98 
 
 
264 aa  258  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  51.92 
 
 
261 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  51.15 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  52.65 
 
 
266 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  49.24 
 
 
262 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  49.04 
 
 
262 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.27 
 
 
262 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.38 
 
 
269 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
269 aa  246  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.23 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  51.53 
 
 
264 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.43 
 
 
269 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  51.53 
 
 
264 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  51.14 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  51.53 
 
 
290 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  51.53 
 
 
290 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  52.26 
 
 
278 aa  242  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  51.34 
 
 
264 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  51.71 
 
 
261 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  51.71 
 
 
261 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.18 
 
 
269 aa  238  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  51.71 
 
 
261 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.08 
 
 
269 aa  237  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
270 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  50.97 
 
 
280 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  51.74 
 
 
272 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  51.74 
 
 
272 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
269 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  52.27 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  51.39 
 
 
269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.67 
 
 
260 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  50.58 
 
 
269 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  49.24 
 
 
265 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.68 
 
 
270 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  49.2 
 
 
269 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  48.35 
 
 
272 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.62 
 
 
272 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  46.39 
 
 
267 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.51 
 
 
269 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.33 
 
 
261 aa  215  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 
263 aa  202  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.25 
 
 
255 aa  188  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 
257 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.95 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
258 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
258 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
258 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
259 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
251 aa  156  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
257 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
254 aa  148  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
259 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
258 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
258 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 
262 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 
260 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
258 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
271 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.884728  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
257 aa  141  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.45 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.45 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.45 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
258 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
255 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
255 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>