More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4159 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  78.68 
 
 
258 aa  411  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  77.04 
 
 
260 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  76.47 
 
 
260 aa  407  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  76.08 
 
 
260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  72.94 
 
 
288 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.09 
 
 
261 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  72.31 
 
 
262 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.44 
 
 
273 aa  364  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  67.89 
 
 
268 aa  354  6.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  65.76 
 
 
268 aa  351  5.9999999999999994e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 
264 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  64.45 
 
 
264 aa  344  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 
264 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  67.84 
 
 
267 aa  328  6e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  65.43 
 
 
263 aa  324  9e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  61.07 
 
 
261 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 
261 aa  316  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 
262 aa  315  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  58.27 
 
 
261 aa  314  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  62.2 
 
 
262 aa  311  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 
261 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.26 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  61.02 
 
 
261 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
261 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
261 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
261 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  59.45 
 
 
261 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.24 
 
 
266 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5119  enoyl-CoA hydratase  59.45 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21776  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4586  enoyl-CoA hydratase  58.66 
 
 
261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.29 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.63 
 
 
273 aa  265  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.32 
 
 
263 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  53.33 
 
 
275 aa  259  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  47.81 
 
 
256 aa  248  7e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  47.81 
 
 
256 aa  248  7e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.27 
 
 
262 aa  241  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.94 
 
 
281 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
262 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 
265 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 
265 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  45.71 
 
 
279 aa  228  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0750  enoyl-CoA hydratase  47.84 
 
 
263 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.8 
 
 
269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.33 
 
 
261 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.78 
 
 
266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1895  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.09 
 
 
288 aa  221  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.71 
 
 
276 aa  221  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0090  enoyl-CoA hydratase  49.22 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2396  methylglutaconyl-CoA hydratase  46.5 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2324  methylglutaconyl-CoA hydratase  46.5 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  46.5 
 
 
286 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
266 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1717  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
288 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
279 aa  218  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 
292 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  45.9 
 
 
271 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.67 
 
 
266 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
272 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  44.86 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
266 aa  214  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.27 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.27 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.86 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2975  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.86 
 
 
289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.517707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  44.26 
 
 
271 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1528  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.86 
 
 
293 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837237  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  44.9 
 
 
266 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2468  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
291 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.680829  normal  0.0128185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
271 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.94 
 
 
279 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
266 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
266 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
266 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
271 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0383  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
259 aa  207  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0361289  hitchhiker  0.00761881 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1515  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.39 
 
 
262 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00100  enoyl-CoA hydratase  47.39 
 
 
265 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0191435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.27 
 
 
270 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
264 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2737  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.62 
 
 
282 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1810  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  42.62 
 
 
271 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404881  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
264 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1507  enoyl-CoA hydratase  48.24 
 
 
261 aa  205  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20368  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1792  hypothetical protein  43.62 
 
 
276 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0889  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
275 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3825  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.58 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000788049 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1791  hypothetical protein  43.62 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  41.56 
 
 
261 aa  198  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0977  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>