More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0146 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
260 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  89.23 
 
 
260 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  81.25 
 
 
266 aa  377  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.86 
 
 
270 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.63 
 
 
265 aa  358  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  62.35 
 
 
273 aa  308  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 
275 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.02 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.75 
 
 
276 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  58.2 
 
 
275 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 
264 aa  295  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  58.3 
 
 
275 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  58.82 
 
 
275 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  58.89 
 
 
261 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  58.89 
 
 
261 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.1 
 
 
275 aa  284  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 
261 aa  284  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.72 
 
 
263 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  56.52 
 
 
270 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 
266 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 
274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  54.33 
 
 
262 aa  265  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 
261 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.37 
 
 
274 aa  263  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  51.92 
 
 
262 aa  261  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.94 
 
 
266 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  55.47 
 
 
264 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  56.86 
 
 
261 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  56.86 
 
 
261 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  56.86 
 
 
261 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  55.08 
 
 
278 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  54.65 
 
 
264 aa  254  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  54.23 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  50.58 
 
 
277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  54.23 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  54.23 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.57 
 
 
269 aa  251  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  53.15 
 
 
264 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.41 
 
 
265 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  54.26 
 
 
264 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 
269 aa  247  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  52.76 
 
 
266 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  51.78 
 
 
264 aa  244  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 
273 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  51.55 
 
 
265 aa  242  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  50.98 
 
 
269 aa  242  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.74 
 
 
262 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  55.12 
 
 
261 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.59 
 
 
269 aa  238  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 
267 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  52.57 
 
 
269 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.37 
 
 
260 aa  235  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.53 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  54.1 
 
 
269 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  52.17 
 
 
269 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 
269 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.31 
 
 
270 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  48.03 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.64 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  52.17 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.55 
 
 
261 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.9 
 
 
269 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.45 
 
 
269 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.31 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
258 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
258 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
254 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
258 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
258 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  38 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
260 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.19 
 
 
255 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 
256 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.09 
 
 
273 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
255 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
257 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.78 
 
 
255 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
259 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.95 
 
 
255 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
264 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
260 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
259 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  35.95 
 
 
262 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
252 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
258 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>