More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3104 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  89.42 
 
 		 275 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  88.36 
 
 		 275 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  74.91 
 
 		 275 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  74.81 
 
 		 273 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.89 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.96 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  60.98 
 
 		 266 aa  308  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.27 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.08 
 
 		 260 aa  293  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  61.22 
 
 		 261 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  57.53 
 
 		 270 aa  288  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.85 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.73 
 
 		 266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.31 
 
 		 266 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.69 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.92 
 
 		 270 aa  279  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  56.42 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  57.25 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  54.62 
 
 		 261 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.63 
 
 		 265 aa  271  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  53.94 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  54.62 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.29 
 
 		 265 aa  268  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  61.98 
 
 		 261 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  52.11 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  50.75 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 		 277 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.87 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  54.75 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.79 
 
 		 262 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.1 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  51.85 
 
 		 269 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.76 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.76 
 
 		 269 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 		 278 aa  248  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 		 290 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 		 290 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  52.69 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 		 264 aa  244  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  52.47 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  52.47 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  52.47 
 
 		 261 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.61 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  50.58 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  54.44 
 
 		 272 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  54.44 
 
 		 272 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  53.57 
 
 		 272 aa  242  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 		 280 aa  241  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  53.46 
 
 		 264 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.37 
 
 		 269 aa  241  9e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  52.53 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  51.6 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.78 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  50.8 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.81 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.48 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.26 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.09 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  49.26 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.7 
 
 		 263 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.08 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  41.53 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.884728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1984  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.928303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.18 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.18 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 258 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>