More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4125 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
257 aa  511  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  77.51 
 
 
257 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.67 
 
 
255 aa  335  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.23 
 
 
263 aa  299  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  47.79 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46 
 
 
270 aa  201  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  45.1 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  47.2 
 
 
270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  49.19 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 
273 aa  194  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  46.8 
 
 
266 aa  194  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  46.83 
 
 
261 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  46.83 
 
 
261 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  46.83 
 
 
261 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  46.06 
 
 
275 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.96 
 
 
274 aa  192  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
269 aa  191  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 
265 aa  191  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  45.74 
 
 
264 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
278 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  45.74 
 
 
290 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  45.74 
 
 
290 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 
269 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  46.06 
 
 
264 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  45.28 
 
 
275 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
272 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
264 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  43.7 
 
 
275 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 
266 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 
264 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
269 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 
272 aa  185  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  43.54 
 
 
273 aa  184  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.45 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.75 
 
 
270 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
272 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
272 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 
263 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  45.77 
 
 
280 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  44.63 
 
 
269 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.7 
 
 
276 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  42.35 
 
 
265 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  44.08 
 
 
269 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  42.58 
 
 
274 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.44 
 
 
262 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 
260 aa  175  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  44 
 
 
257 aa  175  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  45.68 
 
 
267 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  44.9 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 
260 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 
269 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 
266 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  45.67 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 
264 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.14 
 
 
260 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.08 
 
 
261 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
273 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 
270 aa  158  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 
266 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  42.99 
 
 
273 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
262 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
275 aa  151  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
261 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 
265 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
261 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 
258 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
258 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
261 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
260 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
263 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
266 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
257 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3470  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
255 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 
266 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
255 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17860  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.13 
 
 
262 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213095  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
265 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
260 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
288 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>