More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1262 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
265 aa  535  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
259 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
257 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
259 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
259 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
263 aa  142  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 
265 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
257 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
259 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
257 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
257 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
258 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
258 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2822  cyclohexa-1,5-dienecarbonyl-CoA hydratase  30.08 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 
263 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 
263 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 
256 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
257 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3963  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
265 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
259 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
260 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1746  short chain enoyl-CoA hydratase  28.74 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.13 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
259 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
258 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  31.01 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1432  cyclohexa-1,5-dienecarbonyl-CoA hydratase  29.67 
 
 
268 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2952  cyclohexa-1,5-dienecarbonyl-CoA hydratase  29.25 
 
 
258 aa  128  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.599205  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
266 aa  128  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.03 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  30.98 
 
 
283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.26 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.64 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.62 
 
 
260 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
258 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.66 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.19 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
264 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
262 aa  125  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 
263 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
258 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
267 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.07 
 
 
261 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
257 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
258 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 
262 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.89 
 
 
260 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
269 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
257 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
258 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
259 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  30.37 
 
 
257 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
257 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
261 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
275 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.33 
 
 
659 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
256 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  28.29 
 
 
257 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
259 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
258 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 
258 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
260 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
258 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
258 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>