More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1432 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1432  cyclohexa-1,5-dienecarbonyl-CoA hydratase  100 
 
 
268 aa  540  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2822  cyclohexa-1,5-dienecarbonyl-CoA hydratase  92.57 
 
 
269 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  72.16 
 
 
256 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.400047  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2952  cyclohexa-1,5-dienecarbonyl-CoA hydratase  67.84 
 
 
258 aa  359  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.599205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.67 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
257 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  31.65 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
257 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
257 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
257 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  32.46 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
797 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  30.3 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.25 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 
261 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.92 
 
 
266 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
258 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
260 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
258 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.1 
 
 
273 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.23 
 
 
662 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
258 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 
262 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
258 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 
265 aa  106  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  30.65 
 
 
260 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 
260 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
257 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  29.92 
 
 
283 aa  105  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  30.17 
 
 
251 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
261 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 
257 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.8 
 
 
662 aa  105  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 
266 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  28.73 
 
 
275 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 
266 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2522  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
257 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.6 
 
 
276 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.36 
 
 
663 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
260 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  28.52 
 
 
275 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 
275 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.92 
 
 
268 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 
264 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
236 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.71 
 
 
257 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
257 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  30.8 
 
 
260 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
256 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.2 
 
 
662 aa  102  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
253 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  29.62 
 
 
259 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
262 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 
273 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
253 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 
265 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.74 
 
 
257 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  30.62 
 
 
261 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  31.01 
 
 
261 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.42 
 
 
260 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
257 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.18 
 
 
258 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  30.62 
 
 
261 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  29.92 
 
 
260 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 
257 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.54 
 
 
264 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  31.01 
 
 
261 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  32.7 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  31.01 
 
 
261 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 
261 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
254 aa  99.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
258 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.39 
 
 
258 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.48 
 
 
253 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  27.2 
 
 
259 aa  99  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  29.48 
 
 
257 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  30.36 
 
 
257 aa  98.6  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.97 
 
 
261 aa  98.6  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
258 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2749  short chain enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
262 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439722  normal  0.238533 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  30.36 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>