More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6427 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  93.46 
 
 		 260 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  82.31 
 
 		 260 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  77.82 
 
 		 262 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  78.21 
 
 		 264 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  52.49 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  51.72 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  51.72 
 
 		 261 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  51.72 
 
 		 261 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  50.19 
 
 		 261 aa  261  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  51.34 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  51.34 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  49.43 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  50.57 
 
 		 261 aa  259  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  50.57 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  50.57 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  50.57 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  50.57 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  50.19 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  50.19 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.29 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 		 797 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  40.53 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 		 273 aa  148  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  35.71 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  36.16 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 		 258 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 		 273 aa  131  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 260 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  32.7 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>