More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1079 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  91.15 
 
 		 273 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.43 
 
 		 257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  52.11 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.66 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 		 259 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  45.02 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  37.64 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  37.26 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  37.26 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  37.26 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  37.26 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  36.88 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  37.26 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  36.88 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.88 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  37.26 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  37.26 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.88 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  36.88 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.37 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.96 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.96 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1463  short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.225465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.4 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 		 797 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 		 270 aa  148  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  37.1 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3916  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  35.5 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  37.4 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  40.4 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 256 aa  138  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0720  2-ketocyclohexanecarboxyl-CoA hydrolase  35.88 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1542  naphthoate synthase  35.5 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.04426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  39.45 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  37.94 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 		 258 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.71 
 
 		 659 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>