More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4573 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 285 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  57.77 
 
 		 254 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  60.64 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  56.4 
 
 		 253 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  59.6 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  54.4 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  55.86 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  56.4 
 
 		 254 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.97 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  54 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 		 253 aa  248  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  54.18 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  58.57 
 
 		 254 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.58 
 
 		 254 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  55.65 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  53.6 
 
 		 273 aa  235  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  47.49 
 
 		 257 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.2 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.4 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  51.81 
 
 		 254 aa  221  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.64 
 
 		 268 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.85 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  47.77 
 
 		 249 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.77 
 
 		 249 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  47.77 
 
 		 249 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  46.37 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  48.43 
 
 		 266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.18 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 264 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.61 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.81 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 		 797 aa  175  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 269 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 269 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.9 
 
 		 252 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  39.38 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  39.38 
 
 		 261 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  39 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  39.38 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  39.38 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  39.38 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  39 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  39 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  38.61 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  38.61 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  38.61 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  38.61 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  38.61 
 
 		 261 aa  159  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  38.61 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.52 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 		 255 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  38.61 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  44 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.28 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2610  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0699041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.51 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.11 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>