More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4033 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  79.54 
 
 		 260 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  67.59 
 
 		 254 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  63.86 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  65.22 
 
 		 254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  59.29 
 
 		 253 aa  294  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  60.71 
 
 		 253 aa  294  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.26 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  61.26 
 
 		 254 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  56.28 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  56.28 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  56.28 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  58.1 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.68 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  65.86 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.29 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  56 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.75 
 
 		 253 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  55.12 
 
 		 254 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.15 
 
 		 254 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  51.76 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.59 
 
 		 256 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.6 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 		 264 aa  194  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.79 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.77 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 		 261 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.59 
 
 		 249 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.8 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  43.14 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 		 259 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.73 
 
 		 797 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  44.05 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  42.32 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  42.32 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.95 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  42.26 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.05 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  42.05 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  42.8 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  42.26 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 		 271 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  42.42 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  42.05 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.42 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.42 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  42.42 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  42.42 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  40.6 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.71 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  39.92 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 269 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 269 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  39.92 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.31 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.92 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.92 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  40.57 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  34.59 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06235  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03410)  44.04 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0989568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.44 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08370  short chain enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0645146  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  38.81 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  37.1 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>