More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5154 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  76.77 
 
 		 254 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  67.98 
 
 		 254 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  67.59 
 
 		 273 aa  315  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  64.96 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  62.99 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  69.17 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  64.57 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.57 
 
 		 254 aa  308  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.17 
 
 		 254 aa  305  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  63.49 
 
 		 260 aa  305  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  59.68 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 		 253 aa  305  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.02 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  59.35 
 
 		 247 aa  294  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  59.35 
 
 		 247 aa  294  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  59.35 
 
 		 247 aa  294  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  62.8 
 
 		 254 aa  291  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.68 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.63 
 
 		 254 aa  271  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  57.72 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.64 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  49.02 
 
 		 255 aa  221  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.4 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.18 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 264 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.36 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.28 
 
 		 268 aa  184  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  44.74 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 		 267 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  41.37 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 		 287 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 		 797 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.09 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  43.37 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  40.38 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.75 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  38.78 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  40.38 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  40.38 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  41.98 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0542068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  38.4 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  40 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  40 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  40 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  40 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  40 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  40 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  40 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  40 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  40 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  40 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 252 aa  154  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.09 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  40.73 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  37.02 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  37.55 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.59 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.59 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>