More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2640 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  90.53 
 
 		 264 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  69.55 
 
 		 263 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  69.11 
 
 		 269 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  68.73 
 
 		 269 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  68.73 
 
 		 269 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  65.91 
 
 		 266 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  67.7 
 
 		 287 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.39 
 
 		 273 aa  345  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  64.5 
 
 		 266 aa  340  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.67 
 
 		 263 aa  330  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.26 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.46 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.79 
 
 		 270 aa  231  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.24 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  43.65 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  43.65 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  43.65 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  42.58 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  41.64 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.42 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  45.14 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 		 254 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.67 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  40.73 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  41 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.43 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.43 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  42.02 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.04 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.59 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.88 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.01 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>