More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3481 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.86 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  43.19 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.54 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.05 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  40.07 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.82 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.51 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.51 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  40.96 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.7 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  41.48 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  41.26 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  41.48 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  42.65 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.93 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  44.23 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.53 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.53 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.79 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.53 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.3 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.96 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  39.71 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.07 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  39.42 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  42.12 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  39.71 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  39.42 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.42 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.65 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  40.52 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  39.42 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  39.42 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  39.42 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  40.45 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 		 258 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  39.7 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.89 
 
 		 659 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.98 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  40.07 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.89 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.26 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39.26 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.17 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.29 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.78 
 
 		 662 aa  152  7e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  38.91 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  40.67 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  38.91 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39.26 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  38.91 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  38.91 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  39.93 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.45 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  38.91 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>