More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4306 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.92 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  50.39 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.64 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.58 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  46.77 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  45.17 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.69 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  46.69 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  46.69 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  46 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  46.69 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.92 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.2 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.56 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.64 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  41.96 
 
 		 662 aa  189  5e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 		 262 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42.69 
 
 		 662 aa  188  7e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  44.23 
 
 		 661 aa  187  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.82 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.76 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  43.14 
 
 		 662 aa  186  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.67 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 262 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  42.13 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  44.22 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.02 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.14 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  44.92 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.932872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  42.97 
 
 		 663 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.02 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  43.37 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  42.13 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  40.64 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 		 277 aa  181  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 		 260 aa  181  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  46.61 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  42 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.47 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.8 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.6 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.76 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.76 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  44.92 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  43.19 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  41.02 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 		 260 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.13 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  43.08 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  42 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.27 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.173694 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.73 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>