More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2628 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  81.71 
 
 		 263 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.73 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 		 257 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  44.4 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.71 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.04859 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.5 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  43.58 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  43.19 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  42.19 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  43.19 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  43.72 
 
 		 261 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  46.06 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.08 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  44.09 
 
 		 257 aa  192  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.05 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  42.86 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.63 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  43.19 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.16 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  40.75 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.53 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.06 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  42.37 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.47 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 		 258 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.41 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.41 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.36 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.08 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  43.53 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1190  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 		 258 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 		 257 aa  178  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  43.92 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.3 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>