More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3343 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
263 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  81.71 
 
 
261 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  43.53 
 
 
257 aa  201  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 
257 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  41.86 
 
 
255 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  41.86 
 
 
255 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 
262 aa  195  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 
255 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.74 
 
 
266 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  41.47 
 
 
255 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
261 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
258 aa  191  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  43.65 
 
 
257 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 
259 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
261 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
268 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 
258 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 
257 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 
258 aa  182  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 
257 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
258 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  43.39 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 
260 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  42.56 
 
 
269 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
257 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.19 
 
 
255 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  42.19 
 
 
251 aa  180  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  41.02 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  41.02 
 
 
259 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
256 aa  178  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.5 
 
 
257 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
258 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
258 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
258 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 
257 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 
258 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.29 
 
 
260 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
258 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  42.45 
 
 
260 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  39.04 
 
 
283 aa  176  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.56 
 
 
265 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.94 
 
 
265 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  41.5 
 
 
258 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
264 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.06 
 
 
256 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.71 
 
 
257 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 
259 aa  175  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 
257 aa  175  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 
259 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
258 aa  175  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
257 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
257 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
257 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  41.96 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  43.61 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.7 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.7 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
258 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
258 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6084  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 
257 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 
260 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 
260 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 
265 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 
260 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 
258 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 
258 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  38.29 
 
 
257 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  38.29 
 
 
257 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 
258 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.82 
 
 
262 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
258 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 
267 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
259 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 
257 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.53 
 
 
260 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  39.39 
 
 
262 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 
259 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
254 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 
258 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0166  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
249 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>