More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3309 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  91.15 
 
 
260 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.86 
 
 
257 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  48.84 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.74 
 
 
271 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  47.06 
 
 
265 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 
259 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
259 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
259 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  43.27 
 
 
267 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
259 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 
259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.71 
 
 
264 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
256 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
256 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  35.74 
 
 
261 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 
261 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
249 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 
261 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  34.98 
 
 
261 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 
297 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
261 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  36.5 
 
 
297 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 
261 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 
261 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  38.31 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  35.36 
 
 
261 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.12 
 
 
261 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  36.12 
 
 
261 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
257 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  36.12 
 
 
261 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.74 
 
 
297 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  36.12 
 
 
261 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.12 
 
 
261 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
258 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 
261 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
254 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
256 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
256 aa  148  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
260 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
258 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.93 
 
 
270 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
260 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3916  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  35.85 
 
 
260 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
260 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
260 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
258 aa  143  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 
797 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1463  short chain enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.225465  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 
255 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
264 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
290 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
290 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
278 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
258 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
266 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
269 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
263 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
269 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
269 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
269 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  39 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1542  naphthoate synthase  34.85 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.04426  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
263 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0720  2-ketocyclohexanecarboxyl-CoA hydrolase  35.23 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 
287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
254 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  38.55 
 
 
262 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
258 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  38.35 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2124  naphthoate synthase  34.47 
 
 
260 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000363984  normal  0.0450036 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6400  naphthoate synthase  36.76 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.64049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>