More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1463 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1463  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.225465  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  68.36 
 
 
256 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.22 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
265 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
260 aa  168  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
257 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
257 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 
267 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
259 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
259 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
259 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
264 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
269 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
273 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
257 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 
266 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 
261 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
259 aa  151  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
249 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 
249 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 
268 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 
249 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 
270 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
256 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
258 aa  148  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 
266 aa  148  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  38 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  36.11 
 
 
264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.8 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.58 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
260 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
257 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
249 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  35.48 
 
 
283 aa  142  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  35.1 
 
 
266 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 
259 aa  142  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
258 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 
265 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
254 aa  141  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
263 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
256 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  35.57 
 
 
261 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  35.57 
 
 
261 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
797 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.27 
 
 
260 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.91 
 
 
657 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  35.57 
 
 
261 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  35.18 
 
 
261 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 
258 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
259 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
267 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.88 
 
 
260 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
257 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  35.97 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  35.97 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  35.18 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.83 
 
 
297 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  35.83 
 
 
297 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
262 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
264 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  35.97 
 
 
261 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.97 
 
 
261 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  36 
 
 
657 aa  135  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
258 aa  135  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
257 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  32.17 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.43 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
258 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>