More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1280 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 260 aa  523  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  79.54 
 
 		 273 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  63.86 
 
 		 254 aa  318  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  63.49 
 
 		 254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  62 
 
 		 253 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  61.75 
 
 		 254 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  61.11 
 
 		 253 aa  299  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  63.1 
 
 		 254 aa  298  6e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  64.52 
 
 		 254 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  63.2 
 
 		 254 aa  294  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.49 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.8 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  58.3 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  58.3 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  58.3 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  65.08 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.24 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  57.63 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.96 
 
 		 253 aa  258  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  53.53 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  55.38 
 
 		 254 aa  250  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 		 256 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.86 
 
 		 285 aa  248  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.55 
 
 		 254 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  50.39 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 		 249 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.58 
 
 		 249 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  44.58 
 
 		 249 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  44.58 
 
 		 249 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.64 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.64 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 		 797 aa  178  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  41.92 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  41.92 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  41.92 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  41.27 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  42.46 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  42.25 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  42.41 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  42.25 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  41.34 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.79 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  41.34 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.15 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  40.94 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  40.94 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  41.34 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 		 261 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  40.94 
 
 		 261 aa  165  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.94 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  40.94 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  40.94 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  40.94 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  40.94 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  40.94 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  41.34 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  41.35 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  38.96 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.35 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  37.9 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.07 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.07 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.07 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  40.4 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.51 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>