More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5164 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
254 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  80.71 
 
 
254 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.9 
 
 
254 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  67.59 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  66.8 
 
 
253 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  66.14 
 
 
254 aa  323  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  62.45 
 
 
254 aa  304  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  61.02 
 
 
254 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  62.8 
 
 
260 aa  295  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  65.27 
 
 
247 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  65.27 
 
 
247 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  65.27 
 
 
247 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.99 
 
 
254 aa  294  9e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 
254 aa  288  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.14 
 
 
253 aa  285  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  59.45 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.06 
 
 
254 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  56.13 
 
 
257 aa  280  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  61.26 
 
 
273 aa  275  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  63.2 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  57.77 
 
 
254 aa  263  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  58.5 
 
 
254 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.97 
 
 
285 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.23 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.65 
 
 
249 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.39 
 
 
261 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  47.45 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.52 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  46.96 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  46.96 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.96 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 
264 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  47.79 
 
 
266 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 
261 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 
261 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 
264 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
269 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.52 
 
 
259 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
273 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.01 
 
 
267 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  40.08 
 
 
261 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
255 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
266 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 
267 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  39.46 
 
 
261 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  39.46 
 
 
261 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 
263 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
261 aa  158  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  39.85 
 
 
261 aa  158  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 
797 aa  158  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  39.08 
 
 
261 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  39.08 
 
 
261 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  38.93 
 
 
297 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
261 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
266 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  38.93 
 
 
297 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  38.93 
 
 
261 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
260 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  38.93 
 
 
297 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  38.93 
 
 
261 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
259 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  39.02 
 
 
261 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.16 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  38.93 
 
 
261 aa  155  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
255 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
255 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
255 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 
269 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 
269 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
258 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  40.82 
 
 
259 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 
269 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.71 
 
 
240 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
261 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 
259 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 
258 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
267 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
261 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 
265 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
260 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.02 
 
 
260 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
265 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
271 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 
257 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  41.41 
 
 
250 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0542068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.66 
 
 
260 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
266 aa  148  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>