More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1283 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  62.8 
 
 
254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  59.04 
 
 
254 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
253 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  61.75 
 
 
254 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 
254 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 
253 aa  292  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  60.56 
 
 
254 aa  288  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  59.02 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  59.02 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  59.02 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  57.37 
 
 
254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.31 
 
 
254 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.77 
 
 
254 aa  277  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.15 
 
 
254 aa  275  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  54.22 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.17 
 
 
253 aa  269  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  59.44 
 
 
254 aa  268  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 
262 aa  266  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  55.38 
 
 
260 aa  262  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.2 
 
 
254 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.17 
 
 
256 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  55.12 
 
 
273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.81 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.98 
 
 
249 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  46.27 
 
 
255 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
264 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.92 
 
 
268 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 
261 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 
255 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
264 aa  191  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  43.37 
 
 
249 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  43.37 
 
 
249 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 
249 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  43.89 
 
 
266 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.56 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.89 
 
 
271 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 
269 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.28 
 
 
269 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 
266 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.64 
 
 
240 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 
287 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
266 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
269 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
269 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
797 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  44.35 
 
 
257 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  42.05 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
259 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
263 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  40.53 
 
 
261 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  42.74 
 
 
259 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 
259 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.12 
 
 
267 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  40.53 
 
 
261 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
261 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
261 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 
263 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
261 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
297 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
261 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
261 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  40.15 
 
 
297 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 
261 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  39.77 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  39.77 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  39.77 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
297 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  40.73 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
255 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.34 
 
 
252 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
257 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
271 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05852  conserved hypothetical protein  38.58 
 
 
287 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00318706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
255 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
257 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
255 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
255 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
260 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
257 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
258 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
260 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
256 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
258 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
273 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.62 
 
 
659 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5251  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.48 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  36.61 
 
 
272 aa  152  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 
266 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.7 
 
 
250 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0542068 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>