More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1828 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 240 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  43.18 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  42.92 
 
 		 254 aa  164  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.17 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  45.97 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  40.18 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  42.79 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  38.33 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.53 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  43.64 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.89 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  38.94 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  40.09 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  40.17 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  39.74 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.01 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.79 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.5 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.12 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.44 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.44 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  42.72 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  42.44 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.26 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  41.95 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.71 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.5 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.49 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  39.91 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  41.95 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  41.46 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  41.46 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.99 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.46 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.46 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  41.46 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.46 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  41.46 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 260 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.65 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  38.43 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  37.61 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.63 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.41 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  37.96 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  37.96 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  37.96 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  41.55 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.51 
 
 		 256 aa  131  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.82 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.2 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.35 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.35 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  38.05 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  39.9 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.4 
 
 		 797 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.45 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.32 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 		 259 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.35 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  37.81 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4318  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.44 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.81 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  40.19 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 		 267 aa  124  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  41.15 
 
 		 651 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.4 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  38.79 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  37.39 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  37.39 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  37.73 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>