More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4318 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4318  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
250 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
260 aa  228  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
265 aa  227  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.34 
 
 
258 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  47.97 
 
 
257 aa  221  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  49.59 
 
 
259 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.97 
 
 
258 aa  221  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  47.97 
 
 
257 aa  221  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.6 
 
 
259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  49.79 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  49.79 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  49.79 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  48.77 
 
 
257 aa  218  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.82 
 
 
259 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  48.98 
 
 
257 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  48.57 
 
 
257 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
257 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.19 
 
 
259 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
257 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
257 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.34 
 
 
258 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  47.15 
 
 
258 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.19 
 
 
259 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
257 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.56 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.5 
 
 
257 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  46.94 
 
 
257 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.98 
 
 
259 aa  214  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.92 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  46.53 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.97 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  44.67 
 
 
258 aa  211  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.35 
 
 
262 aa  211  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.44 
 
 
259 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.89 
 
 
257 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  43.37 
 
 
257 aa  208  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
259 aa  208  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  43.37 
 
 
257 aa  207  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  45.93 
 
 
257 aa  207  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.94 
 
 
255 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
256 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 
258 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  47.72 
 
 
257 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.58 
 
 
257 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.82 
 
 
258 aa  205  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.35 
 
 
258 aa  204  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  45.6 
 
 
258 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  45.71 
 
 
258 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6084  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
258 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
258 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  46.44 
 
 
277 aa  201  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.44 
 
 
259 aa  201  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.75 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
258 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.4 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2905  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.37 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433912  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.12 
 
 
259 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  43.75 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.09 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  45.93 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.97 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  46.34 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
265 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
258 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
258 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  46.75 
 
 
258 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4646  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 
259 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
259 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 
258 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
262 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  44.13 
 
 
258 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.68 
 
 
257 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 
256 aa  191  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
258 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 
266 aa  190  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  44.76 
 
 
258 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  44.76 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  44.76 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
258 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.72 
 
 
259 aa  188  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
264 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 
258 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
258 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
258 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 
258 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
258 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.2 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>