More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3853 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
256 aa  517  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  60 
 
 
255 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  54.37 
 
 
253 aa  261  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  53.25 
 
 
247 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  53.25 
 
 
247 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  53.97 
 
 
253 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  53.25 
 
 
247 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  52.4 
 
 
254 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  51 
 
 
257 aa  244  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  51.56 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.97 
 
 
253 aa  238  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  52.78 
 
 
254 aa  234  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  51.17 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  50.4 
 
 
254 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 
260 aa  232  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 
254 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.23 
 
 
254 aa  228  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
262 aa  225  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 
273 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  46.64 
 
 
254 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.2 
 
 
285 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  46.03 
 
 
254 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.41 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.22 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
255 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.14 
 
 
268 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.14 
 
 
261 aa  188  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 
249 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  45.08 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  42.57 
 
 
249 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  42.57 
 
 
249 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.57 
 
 
249 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  43.41 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
273 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  43.18 
 
 
297 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  41.29 
 
 
260 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  43.56 
 
 
261 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
264 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  43.94 
 
 
297 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  44.32 
 
 
261 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  43.94 
 
 
297 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.94 
 
 
261 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  43.94 
 
 
261 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  43.94 
 
 
261 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  43.77 
 
 
261 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  43.18 
 
 
261 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  43.77 
 
 
261 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  43.77 
 
 
261 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  43.77 
 
 
261 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  42.32 
 
 
261 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  43.4 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
261 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  42.4 
 
 
257 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
797 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  42.05 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.17 
 
 
240 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
260 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
259 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
259 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  37.97 
 
 
266 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 
259 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 
267 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  40.68 
 
 
264 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
259 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
257 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  38.71 
 
 
272 aa  155  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
261 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
263 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
260 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
261 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
266 aa  151  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 
263 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 
269 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
259 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
260 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 
265 aa  149  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
273 aa  148  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
255 aa  148  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.93 
 
 
255 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 
263 aa  148  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.93 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.93 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  43.66 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.95 
 
 
266 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
259 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 
258 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>