More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3355 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
797 aa  1579    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  48.93 
 
 
509 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  48.93 
 
 
509 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
509 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  48.44 
 
 
509 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  48.25 
 
 
509 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  46.18 
 
 
510 aa  372  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  36.85 
 
 
517 aa  281  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  52.55 
 
 
257 aa  241  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  51.56 
 
 
259 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
259 aa  231  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
259 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  49.6 
 
 
259 aa  226  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  37.56 
 
 
474 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  37.56 
 
 
474 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  37.56 
 
 
474 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  33.6 
 
 
506 aa  217  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  49.19 
 
 
259 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  36.69 
 
 
439 aa  203  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
491 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  36.07 
 
 
486 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  33.97 
 
 
491 aa  195  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  43.13 
 
 
261 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  43.13 
 
 
297 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.13 
 
 
261 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  42.75 
 
 
261 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  42.53 
 
 
261 aa  192  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  43.13 
 
 
297 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  43.13 
 
 
261 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  42.42 
 
 
297 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  42.91 
 
 
261 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  43.13 
 
 
261 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  32.1 
 
 
492 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  32.1 
 
 
492 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  32.1 
 
 
492 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  43.02 
 
 
261 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.26 
 
 
261 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  42.26 
 
 
261 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  42.26 
 
 
261 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  41.89 
 
 
261 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  28.79 
 
 
477 aa  181  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  41.22 
 
 
261 aa  180  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  32.33 
 
 
494 aa  177  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  32.87 
 
 
515 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  41.02 
 
 
265 aa  174  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 
258 aa  174  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 
260 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
258 aa  171  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.25 
 
 
265 aa  171  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
261 aa  171  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 
257 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
271 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
285 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
255 aa  165  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 
256 aa  165  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.48 
 
 
255 aa  165  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.48 
 
 
255 aa  165  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 
267 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
247 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
247 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
247 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  33.86 
 
 
494 aa  163  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 
261 aa  163  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.08 
 
 
255 aa  163  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 
264 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
260 aa  163  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  41.5 
 
 
254 aa  162  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 
249 aa  163  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  43.6 
 
 
253 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
266 aa  161  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  41.25 
 
 
260 aa  161  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  43.98 
 
 
254 aa  160  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
258 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  29.63 
 
 
498 aa  160  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
260 aa  160  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
259 aa  160  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
258 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
268 aa  160  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 
258 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
254 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  41.54 
 
 
260 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
258 aa  158  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  31.08 
 
 
504 aa  158  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
253 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 
257 aa  157  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
257 aa  157  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 
254 aa  157  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  39 
 
 
260 aa  157  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 
277 aa  157  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
258 aa  156  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  38.91 
 
 
260 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
261 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  39.53 
 
 
264 aa  157  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 
259 aa  156  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
260 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 
258 aa  156  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 
258 aa  156  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
264 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
260 aa  155  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
259 aa  155  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>