More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0124 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
254 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  89.76 
 
 
254 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  68.38 
 
 
254 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  69.17 
 
 
254 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  62.99 
 
 
253 aa  316  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  65.22 
 
 
254 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  60.87 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  65.08 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  57.26 
 
 
247 aa  297  9e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  57.26 
 
 
247 aa  297  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  57.26 
 
 
247 aa  297  9e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  62.85 
 
 
254 aa  292  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  60.87 
 
 
254 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  65.86 
 
 
273 aa  289  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.45 
 
 
254 aa  285  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  56.52 
 
 
257 aa  285  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.87 
 
 
254 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.27 
 
 
253 aa  281  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  59.44 
 
 
254 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.5 
 
 
254 aa  279  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.68 
 
 
254 aa  278  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.78 
 
 
256 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.57 
 
 
285 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 
262 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 
255 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  47.66 
 
 
264 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.24 
 
 
249 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 
264 aa  198  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 
287 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
263 aa  192  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
266 aa  191  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 
273 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 
269 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
269 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
269 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.14 
 
 
268 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 
271 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
249 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
249 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
249 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  42.42 
 
 
266 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.25 
 
 
270 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 
266 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.25 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.63 
 
 
269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
267 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  41.98 
 
 
261 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  42.75 
 
 
261 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  42.75 
 
 
261 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  45.14 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 
797 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.37 
 
 
261 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  42.37 
 
 
261 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.37 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 
297 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  41.6 
 
 
297 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 
297 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  42.34 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  42.26 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  41.6 
 
 
261 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
259 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
264 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.112796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
266 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.25 
 
 
234 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
261 aa  159  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.55 
 
 
240 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 
266 aa  158  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
259 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
259 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  37.65 
 
 
272 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
256 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  39.77 
 
 
262 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
259 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 
258 aa  155  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  40.53 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.43 
 
 
265 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
258 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
259 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  38.49 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05852  conserved hypothetical protein  39.02 
 
 
287 aa  152  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00318706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
252 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  37.55 
 
 
260 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
256 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
258 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  40.84 
 
 
257 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 
259 aa  149  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
258 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  35.63 
 
 
260 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
258 aa  148  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>