More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1968 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 266 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.62 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.86 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  42.32 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.26 
 
 		 271 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  41.29 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.42 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.51 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  37.78 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.1 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.45 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.55 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  36.8 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  39.25 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2610  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0699041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.12 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.12 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  38.29 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.98 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.7 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  35.93 
 
 		 264 aa  148  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2709  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2694  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2664  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  39.26 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  38.49 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  34.2 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  37.73 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 797 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  36.4 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  36.76 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  36.76 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  34.12 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  34.07 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.4 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  36.4 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.4 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.85 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.07 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.884728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.24 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 		 264 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2844  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>