More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5509 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 265 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 265 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.25 
 
 		 265 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  92.42 
 
 		 266 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.58 
 
 		 262 aa  278  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.297367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  45.24 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  45.24 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  45.24 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  45.24 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  45.24 
 
 		 261 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  45.24 
 
 		 261 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3664  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  44.44 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  43.25 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  43.25 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  41.37 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.86 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  42.86 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.86 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 259 aa  174  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.34 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.51 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  43.65 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  43.08 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.66 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  41.04 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.55 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  42.8 
 
 		 261 aa  165  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  41.37 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.3 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.3 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.3 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  39.44 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  39.84 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.91 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.91 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.62 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.18 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.96 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  44.13 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.29 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  40.65 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  42.4 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.74 
 
 		 662 aa  149  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.6 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.25 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 269 aa  148  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>