More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4479 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 259 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  44.12 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  40.81 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  41.26 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  43.4 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  41.26 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.3 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  39.57 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.66 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.66 
 
 		 797 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  45.79 
 
 		 253 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 		 263 aa  144  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  43.72 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.41 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.23 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  42.61 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.23 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  47.78 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.73 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 273 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 		 266 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.17 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  45.02 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.18 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  40.55 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>