More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0387 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  86.21 
 
 		 260 aa  460  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  85.06 
 
 		 261 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  75.47 
 
 		 267 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  61.74 
 
 		 267 aa  314  8e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.03 
 
 		 260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  58.2 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.65 
 
 		 255 aa  292  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  62.88 
 
 		 263 aa  288  6e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  59.46 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  59.53 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  64.76 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  64.76 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  64.76 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  58.59 
 
 		 252 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.61 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 		 245 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  61.18 
 
 		 257 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 		 257 aa  266  4e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  60.78 
 
 		 252 aa  258  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  59.3 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  57.93 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  56.73 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  56.39 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  60.38 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  58.5 
 
 		 248 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  61.97 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  52.53 
 
 		 259 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  52.52 
 
 		 296 aa  238  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  60.39 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  51.72 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 		 292 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  51.54 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.64 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.66 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 259 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  39.39 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  39.53 
 
 		 262 aa  131  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  40.18 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.71 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  39.41 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  36.16 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.98 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 		 797 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  39.01 
 
 		 259 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 		 268 aa  128  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  35.52 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  35.52 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  40.1 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  35.52 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  35.52 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  35.52 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  35.14 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>