More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01778 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 259 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  72.44 
 
 		 259 aa  315  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  64.96 
 
 		 256 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  64.96 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  66.4 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  65.6 
 
 		 274 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460617 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  59.68 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  61.96 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  60.87 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  65.71 
 
 		 292 aa  272  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.56 
 
 		 260 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 		 266 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  62.96 
 
 		 253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  65.06 
 
 		 274 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  54.79 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  66.26 
 
 		 245 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  59.68 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  56.54 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  54.83 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.61 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  61.5 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  61.5 
 
 		 254 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  61.5 
 
 		 254 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.84 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  62.99 
 
 		 252 aa  241  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  57.83 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.3 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  66.67 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  57.3 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  55.51 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  50.87 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  61.57 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.33 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.61 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  42.42 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  39.41 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  38.66 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  39.49 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  39.49 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  39.49 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  41.92 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.26 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.17 
 
 		 273 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  38.99 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  36.49 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.61 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.94 
 
 		 797 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  37.39 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.12 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.92 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  35.04 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  35.04 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2320  enoyl-CoA hydratase  38.57 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0702253  normal  0.0764248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  39.9 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  35.04 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.15 
 
 		 269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.29 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.27 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  35.04 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  35.04 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.18 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4034  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>