More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0151 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  88.89 
 
 		 261 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  86.21 
 
 		 266 aa  460  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  79.84 
 
 		 267 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  59.47 
 
 		 267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.24 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.7 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  57.42 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 263 aa  275  6e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.57 
 
 		 264 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  61.67 
 
 		 254 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  61.67 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  61.67 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  58.04 
 
 		 265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  60.78 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  58.04 
 
 		 257 aa  265  7e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  57.65 
 
 		 252 aa  265  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  54.83 
 
 		 259 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  56.91 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  59.3 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  56.86 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  55.22 
 
 		 265 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  56.09 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  55.25 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 		 258 aa  241  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  59.29 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  61.14 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.96 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  50.72 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  54.55 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  52.82 
 
 		 274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  53.22 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.79 
 
 		 234 aa  205  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  52.82 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 		 289 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 		 264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.71 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.17 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  42.42 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  43.06 
 
 		 262 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.51 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  38.68 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  38.68 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 		 285 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  39.09 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 		 797 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.62 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06235  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03410)  33.64 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0989568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  38.5 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  37.67 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  37.38 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.46 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.78 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.32 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>