More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0701 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  88.89 
 
 		 260 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  85.06 
 
 		 266 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  77.01 
 
 		 267 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  61.69 
 
 		 267 aa  311  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 		 256 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 		 256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.85 
 
 		 260 aa  301  7.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.48 
 
 		 255 aa  289  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  57.81 
 
 		 257 aa  285  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  61.48 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 		 258 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  62.56 
 
 		 254 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  58.82 
 
 		 252 aa  268  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  62.56 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  62.56 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  57.81 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.04 
 
 		 264 aa  265  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  59.61 
 
 		 257 aa  265  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  58.43 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  58.54 
 
 		 253 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  56.54 
 
 		 259 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 252 aa  258  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  55.64 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  54.58 
 
 		 259 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  63.25 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  55.35 
 
 		 271 aa  241  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  56.47 
 
 		 248 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  62.09 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  59.29 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  50.72 
 
 		 296 aa  228  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  52.43 
 
 		 274 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  54.03 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  52.28 
 
 		 292 aa  208  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.21 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.2 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 273 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.85 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.4 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  42.72 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  34.41 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  38.5 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 		 259 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>