More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3941 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
255 aa  494  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.68 
 
 
260 aa  338  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  68.75 
 
 
253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  64.29 
 
 
258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 
266 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  66.8 
 
 
257 aa  304  8.000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  61.48 
 
 
261 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  60.7 
 
 
260 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  61.24 
 
 
267 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  63.39 
 
 
257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  69.74 
 
 
253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.26 
 
 
264 aa  282  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  58.78 
 
 
267 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  59.76 
 
 
257 aa  278  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  67.12 
 
 
254 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  67.12 
 
 
254 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  67.12 
 
 
254 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  62.7 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  69.13 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  66.14 
 
 
255 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  59.36 
 
 
265 aa  270  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  64.14 
 
 
248 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  60.8 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.08 
 
 
254 aa  268  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  60.78 
 
 
256 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  60.78 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  66.12 
 
 
245 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  64.26 
 
 
262 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  59.6 
 
 
252 aa  248  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  56.3 
 
 
259 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  56.23 
 
 
265 aa  231  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 
274 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  53.68 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  58.13 
 
 
274 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  62.02 
 
 
292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  47.64 
 
 
296 aa  208  7e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.29 
 
 
234 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.3 
 
 
259 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
289 aa  158  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
273 aa  148  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.42 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
264 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  40.72 
 
 
254 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 
247 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.17 
 
 
269 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 
247 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 
247 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
253 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  45.41 
 
 
254 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  42.41 
 
 
260 aa  131  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
263 aa  131  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  37.95 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  41.03 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
269 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
269 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
269 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  42.99 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  38.12 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  43.48 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
261 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  43.46 
 
 
254 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  39.39 
 
 
259 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.4 
 
 
256 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 
266 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.71 
 
 
262 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
261 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.94 
 
 
285 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
254 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
270 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
287 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
269 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.16 
 
 
254 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  40.41 
 
 
259 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.65 
 
 
797 aa  121  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  40.95 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.58 
 
 
273 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  39.65 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.72 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  38.05 
 
 
257 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  38.05 
 
 
257 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  35.4 
 
 
257 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  37.96 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.76 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.5 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
258 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 
259 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>