More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5521 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 273 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.37 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 		 259 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.79 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.44 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.79 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.79 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 		 267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  39.33 
 
 		 276 aa  161  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.73 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.09 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 268 aa  149  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 266 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.26 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 268 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 264 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.08 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.83 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.75 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0087  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 		 279 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 		 262 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6880  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 		 255 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 		 259 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  32.46 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>